Les modes de paiement suivants sont possibles sur Migros Online:
* Cartes de crédit (cartes de crédit Cumulus, Visa, Mastercard, American Express, Diners Club), PostFinance et Twint.
* Facture (par courrier postal ou en ligne)
Selon les commandes, il peut y avoir des restrictions quant aux moyens de paiement disponibles. Au départ, Twint et PostFinance ne sont acceptés que si des commandes ont déjà été passées avec ces moyens de paiement sur le web ou sur l’application Migros Online. C’est aussi une solution temporaire, au cas où ces moyens de paiement devaient être utilisés dans One App.